More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0307 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  68.02 
 
 		 197 aa  275  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  70.56 
 
 		 197 aa  272  2.0000000000000002e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  69.54 
 
 		 197 aa  264  5e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  68.69 
 
 		 198 aa  241  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  46.77 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  52.34 
 
 		 132 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  47.73 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  47.24 
 
 		 365 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  47.24 
 
 		 365 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  47.24 
 
 		 365 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  44.09 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  44.09 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  44.62 
 
 		 391 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  43.31 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  41.54 
 
 		 254 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.19 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  45.97 
 
 		 383 aa  99  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  40.94 
 
 		 154 aa  98.6  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  38.4 
 
 		 313 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  46.83 
 
 		 126 aa  97.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  42.97 
 
 		 370 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  43.75 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  44.19 
 
 		 133 aa  95.5  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  41.41 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  43.31 
 
 		 137 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  39.06 
 
 		 363 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  42.86 
 
 		 216 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.33 
 
 		 364 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  43.2 
 
 		 401 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  39.84 
 
 		 134 aa  85.5  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.98 
 
 		 427 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.7 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  42.96 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.17 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  40.16 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 378 aa  81.3  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.19 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  40.3 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  39.66 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  41.22 
 
 		 366 aa  75.1  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  39.55 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  34.65 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  34.88 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  35.88 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  34.11 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  38.81 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.86 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  35.16 
 
 		 2805 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  37.59 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  31.88 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  40.71 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  37.3 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  39.74 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  32.65 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  40.87 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  40 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  34.03 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  32.06 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  33.33 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  31.39 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  34.48 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  34.03 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  35.82 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  31.39 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  40 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  32.64 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  32.41 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4142  ribonuclease H  32.64 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2570  ribonuclease HI  30.52 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000396954  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  33.56 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1723  ribonuclease H  32.64 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  27.45 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  31.47 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  26.14 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  36.36 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  34.72 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  35.86 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  34.93 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3714  ribonuclease H  32.64 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.246358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  34.67 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  25.49 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  26.8 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  24.67 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  26.77 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>