45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5115 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  791    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  39.71 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  39.71 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  39.11 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  32.54 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  30.23 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  30.23 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  30.23 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  30.11 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.27 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.35 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.65 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  31.58 
 
 		 137 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  37.33 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  30.25 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  33.03 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  40 
 
 		 187 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  36 
 
 		 81 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  38.67 
 
 		 187 aa  53.1  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  35.4 
 
 		 322 aa  50.8  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  29.91 
 
 		 154 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  27.66 
 
 		 133 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  23.62 
 
 		 197 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.14 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  28.57 
 
 		 216 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  29.27 
 
 		 132 aa  48.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  28 
 
 		 199 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  25.42 
 
 		 145 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  23.62 
 
 		 198 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  28.05 
 
 		 142 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  30.77 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  26.79 
 
 		 134 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2143  hypothetical protein  29.69 
 
 		 221 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>