113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44751 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  100 
 
 		 376 aa  785    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  38.85 
 
 		 197 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  39.1 
 
 		 137 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.87 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  39.74 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  39.74 
 
 		 126 aa  84.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  40.72 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  36.42 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.5 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  37.5 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  36.31 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.48 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.48 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.48 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.44 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.37 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  34.21 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  34.21 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  34.21 
 
 		 168 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  35.76 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  35.85 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  35.88 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  36.71 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.8 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  37.66 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  34.44 
 
 		 132 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  52.54 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.67 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 		 363 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  31.01 
 
 		 133 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  40.21 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  49.15 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.95 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  48.33 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  50.88 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.67 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  57.78 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.6 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  33.97 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  32.05 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  27.01 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  37.21 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  26.74 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  26.74 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  27.01 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  38.03 
 
 		 81 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  32.08 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  26.74 
 
 		 219 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  36.05 
 
 		 221 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  26.74 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  38.71 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  39.13 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  27.59 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  34.19 
 
 		 142 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  31.06 
 
 		 139 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 366 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2143  hypothetical protein  26.22 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  32.61 
 
 		 321 aa  52.8  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1213  ribonuclease H  42.86 
 
 		 216 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  40.35 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  30.52 
 
 		 128 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  31.06 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  39.13 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  50 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  45.28 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  46.67 
 
 		 211 aa  51.2  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  36.45 
 
 		 187 aa  50.8  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  29.87 
 
 		 128 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  29.87 
 
 		 128 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  29.87 
 
 		 128 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  29.87 
 
 		 128 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  36.45 
 
 		 187 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  30 
 
 		 154 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  27.49 
 
 		 149 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  29.87 
 
 		 128 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  29.87 
 
 		 128 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  55.26 
 
 		 254 aa  49.7  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  42.37 
 
 		 691 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  29.87 
 
 		 128 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  40 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  43.14 
 
 		 251 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  45.65 
 
 		 487 aa  48.5  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0617  ribonuclease H-related protein  40 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0129838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  26.59 
 
 		 209 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  29.22 
 
 		 128 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  42.86 
 
 		 463 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  51.22 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  28.57 
 
 		 132 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>