125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4219 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  100 
 
 		 313 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  38.49 
 
 		 417 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  39.11 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  38.49 
 
 		 417 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  48.41 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  48.41 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  51.59 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  48.41 
 
 		 168 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  49.21 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  44.88 
 
 		 137 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  43.55 
 
 		 391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  44.8 
 
 		 132 aa  109  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.97 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  43.2 
 
 		 197 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.55 
 
 		 369 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  40.6 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  44.36 
 
 		 411 aa  102  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  41.18 
 
 		 211 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.31 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.31 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.31 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  40.94 
 
 		 126 aa  96.7  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 440 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35.37 
 
 		 383 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.06 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  38.71 
 
 		 197 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.5 
 
 		 378 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  36.11 
 
 		 142 aa  92.4  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  35.71 
 
 		 199 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  39.1 
 
 		 197 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  37.41 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 		 363 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  38.46 
 
 		 134 aa  86.3  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 378 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.23 
 
 		 382 aa  85.9  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  38.4 
 
 		 198 aa  85.9  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  37.4 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  34.04 
 
 		 154 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.24 
 
 		 452 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  40.17 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.2 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  39.67 
 
 		 148 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  33.86 
 
 		 133 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  36.64 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  27.56 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.19 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  36.59 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  41.03 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  35.77 
 
 		 187 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  35.16 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  34.44 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  31.67 
 
 		 154 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  33.86 
 
 		 128 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  33.86 
 
 		 128 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  29.91 
 
 		 131 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  28.24 
 
 		 145 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  27.05 
 
 		 133 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  27.05 
 
 		 133 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  33.07 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  33.07 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  33.07 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  33.07 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  33.07 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  33.07 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  33.07 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  33.07 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  31.01 
 
 		 132 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  33.59 
 
 		 2805 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  32.26 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  33.06 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  35 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  31.43 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  25.38 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  29.2 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  31.45 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  32.52 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  31.45 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  31.45 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  31.45 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  31.45 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  31.45 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  30.65 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  32.61 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2143  hypothetical protein  27.82 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  37.8 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  35.79 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  28.46 
 
 		 151 aa  52.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  29.85 
 
 		 154 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  29.87 
 
 		 154 aa  49.7  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  29.87 
 
 		 154 aa  49.7  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  33.75 
 
 		 157 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37130  predicted protein  36.62 
 
 		 459 aa  49.3  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530874  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  28.33 
 
 		 159 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  31.65 
 
 		 159 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  32.18 
 
 		 157 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  30.12 
 
 		 192 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  31.58 
 
 		 118 aa  47  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>