77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1010 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  100 
 
 		 131 aa  275  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  74.22 
 
 		 133 aa  204  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  74.22 
 
 		 133 aa  204  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  37.6 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  37.6 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  37.6 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  37.6 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  37.6 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  37.6 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  37.6 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  37.6 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  36.8 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  36.8 
 
 		 128 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  34.4 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0926  RNase HI  35.61 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  29.69 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  32.06 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  29.91 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  30.47 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  30.65 
 
 		 216 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  33.07 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1375  RNase HI  30.95 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.65904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  27.78 
 
 		 383 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.98 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  29.23 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  29.55 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25.2 
 
 		 365 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25.2 
 
 		 365 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25.2 
 
 		 365 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  30.7 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  28.83 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  30.08 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  31.54 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  25.6 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  29.46 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  29.01 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  31.01 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  26.12 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 391 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25.41 
 
 		 364 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  24.6 
 
 		 356 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  24.6 
 
 		 254 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  24.59 
 
 		 378 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  24.03 
 
 		 322 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  23.81 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25.98 
 
 		 382 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  24.22 
 
 		 363 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  25.56 
 
 		 198 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  24.8 
 
 		 452 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  23.81 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  23.81 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  24.39 
 
 		 366 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  26.36 
 
 		 401 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  27.2 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  26.77 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  24.19 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1509  hypothetical protein  28.32 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.600334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  28.57 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1584  RNase HI  32.22 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1373  Ribonuclease H  27.72 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000016883  hitchhiker  0.00000157044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  24.78 
 
 		 412 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  22.13 
 
 		 378 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  31.34 
 
 		 215 aa  42  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  26.25 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 440 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  28.03 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  27.78 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  28.95 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  28.24 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  28.95 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  29.63 
 
 		 219 aa  40  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>