32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1261 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1261  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2143  hypothetical protein  75.12 
 
 
221 aa  334  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  50.7 
 
 
219 aa  234  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  50.7 
 
 
219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  50.7 
 
 
219 aa  231  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  50.23 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  50.23 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  49.77 
 
 
219 aa  230  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  51.16 
 
 
219 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  49.77 
 
 
219 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  49.3 
 
 
219 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  49.3 
 
 
219 aa  227  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  49.53 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  38.82 
 
 
198 aa  52.4  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  28.15 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  33.33 
 
 
313 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  31.21 
 
 
383 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  28.06 
 
 
142 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.59 
 
 
369 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  28.57 
 
 
126 aa  45.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  28.47 
 
 
132 aa  45.4  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  28.18 
 
 
376 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  28.3 
 
 
417 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  29.41 
 
 
148 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  28.3 
 
 
417 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 
370 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 
391 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.36 
 
 
356 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  30.15 
 
 
322 aa  42.4  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
401 aa  41.6  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  27.03 
 
 
216 aa  41.6  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  25.17 
 
 
440 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>