More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2015 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 401 aa  797    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  49.61 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.65 
 
 		 382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.96 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.84 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  43.83 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.33 
 
 		 378 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  45.41 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  47.29 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.56 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  47.19 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.26 
 
 		 365 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.26 
 
 		 365 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.26 
 
 		 365 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  46.05 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.22 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  42.46 
 
 		 412 aa  239  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  44.3 
 
 		 402 aa  232  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  41.32 
 
 		 370 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.97 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  66.42 
 
 		 440 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  64.66 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  63.24 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  60.31 
 
 		 137 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  42.72 
 
 		 218 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  40.93 
 
 		 215 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  37.85 
 
 		 243 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 208 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 214 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 209 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 235 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 223 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  41.98 
 
 		 194 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  47.37 
 
 		 133 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  46.4 
 
 		 197 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 206 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  45.97 
 
 		 132 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 213 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27 
 
 		 196 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.02 
 
 		 213 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  34.74 
 
 		 227 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 201 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 201 aa  94  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 201 aa  94  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 207 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 226 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 213 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 226 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  44 
 
 		 168 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.94 
 
 		 203 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.94 
 
 		 203 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 213 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  41.41 
 
 		 254 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 223 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 		 211 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.94 
 
 		 203 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.94 
 
 		 203 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.54 
 
 		 213 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  40.74 
 
 		 211 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.94 
 
 		 203 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  44 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  44 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  44.68 
 
 		 142 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.7 
 
 		 224 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 241 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  36.52 
 
 		 193 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  34.82 
 
 		 245 aa  90.1  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.53 
 
 		 203 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.53 
 
 		 203 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  38.35 
 
 		 154 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 233 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.68 
 
 		 200 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  27.54 
 
 		 208 aa  87  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.17 
 
 		 205 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 209 aa  87  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 223 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  39.26 
 
 		 134 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  41.13 
 
 		 198 aa  86.3  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 200 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.5 
 
 		 229 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  37.4 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 245 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.94 
 
 		 203 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  44 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.77 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.77 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.39 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31.13 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  41.54 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>