More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1761 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
208 aa  432  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  33.67 
 
 
199 aa  121  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.92 
 
 
442 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  26.88 
 
 
243 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 
401 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
198 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30.52 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.52 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.05 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.43 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  31.43 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  31.43 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  31.75 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  30.86 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  30.86 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  30.86 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  31.43 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  31.43 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  28.36 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.02 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.35 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  29.94 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  32.3 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  30.91 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.72 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.72 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  27.03 
 
 
207 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  25.79 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.72 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.9 
 
 
442 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  25.64 
 
 
412 aa  75.5  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.4 
 
 
442 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  26.39 
 
 
445 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  26.79 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  28.87 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  27.89 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.22 
 
 
442 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  24.75 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  28.48 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30 
 
 
444 aa  72.4  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.34 
 
 
442 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
223 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.06 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  26.47 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  26.47 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  25.94 
 
 
447 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  30.12 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  28.1 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.98 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.95 
 
 
547 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.9 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>