More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0499 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  86.78 
 
 		 226 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  86.34 
 
 		 226 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  65.26 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  65.73 
 
 		 229 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  51.87 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  49.28 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  51.22 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  47.3 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  47 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  49.76 
 
 		 213 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  50.71 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  46.85 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  46.85 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  44.95 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  46.61 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  46.61 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  46.12 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  44.04 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  46.08 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  46.61 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  49.28 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  46.61 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  46.61 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  47.6 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  46.08 
 
 		 220 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  45.16 
 
 		 220 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  45.63 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  45.63 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  44.66 
 
 		 221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  45.27 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  43.19 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  41.59 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  45.19 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  39.25 
 
 		 230 aa  144  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  41.78 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  52.47 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.5 
 
 		 205 aa  124  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  40.19 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  38.43 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  40.29 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  39.78 
 
 		 185 aa  118  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 207 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.86 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  45.56 
 
 		 440 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.39 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  43.87 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  48.77 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 188 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  48.15 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.12 
 
 		 378 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  44.65 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.61 
 
 		 378 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  36.94 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  32.32 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  35.68 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 201 aa  101  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 411 aa  101  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  39.74 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  40.35 
 
 		 412 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 		 378 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.39 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 216 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 459 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>