More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1599 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
223 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  81.61 
 
 
223 aa  368  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  51.58 
 
 
225 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  39.61 
 
 
207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  42.36 
 
 
209 aa  142  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 
237 aa  141  9e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.78 
 
 
205 aa  138  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  42.25 
 
 
218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
214 aa  128  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  40.67 
 
 
227 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
209 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
208 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 
224 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.13 
 
 
213 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 
227 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  38.57 
 
 
223 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 
202 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
209 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  37.98 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 
220 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 
220 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  37.5 
 
 
229 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
220 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
220 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
220 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 
218 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 
223 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
240 aa  108  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
229 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 
201 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 
201 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  34.54 
 
 
206 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
220 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 
221 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 
221 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 
220 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.96 
 
 
222 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
208 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 
188 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 
222 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.39 
 
 
203 aa  105  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  36.1 
 
 
229 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 
220 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 
204 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 
220 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 
207 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  38.19 
 
 
208 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 
221 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.55 
 
 
203 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.55 
 
 
203 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  45.57 
 
 
205 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.05 
 
 
378 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
192 aa  101  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 
224 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 
218 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.54 
 
 
203 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.54 
 
 
203 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  42.24 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.54 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.7 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
224 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 
220 aa  99  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 
213 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
440 aa  98.2  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.89 
 
 
369 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.05 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  42.94 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  37.65 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 
459 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.7 
 
 
443 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.35 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  30.39 
 
 
196 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
411 aa  94.7  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  47.47 
 
 
205 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.33 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 
447 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.31 
 
 
442 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
214 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  30.39 
 
 
196 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  29.9 
 
 
196 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.37 
 
 
442 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>