More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0330 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  66.83 
 
 		 215 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  58.41 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  62.5 
 
 		 212 aa  256  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  60.37 
 
 		 227 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  65 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  57.69 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  57.89 
 
 		 213 aa  241  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  58.37 
 
 		 213 aa  240  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  55.98 
 
 		 214 aa  228  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  55.98 
 
 		 214 aa  228  9e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  52.58 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  52.11 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  48.79 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  47.39 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  46.45 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  47 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  47 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  48.57 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  46.54 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  45.97 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  47 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  47 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  47 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  47 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  47 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  47 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  47 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  48.34 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  45.02 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  45.28 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  40.58 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.55 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.02 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 411 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.5 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.5 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.5 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 185 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  40.34 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 440 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  39.1 
 
 		 210 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 		 447 aa  99  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 378 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.39 
 
 		 369 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  46.05 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 210 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 220 aa  95.1  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 449 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  40.51 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 216 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  42.11 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  44.03 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 191 aa  92  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 209 aa  92  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  38.32 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 		 459 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.2 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.2 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  42.77 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>