More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0502 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  73.83 
 
 		 213 aa  312  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  74.41 
 
 		 212 aa  310  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  74.18 
 
 		 213 aa  304  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  66.82 
 
 		 212 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  66.01 
 
 		 215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  67.33 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  64.45 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  57.82 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  55.98 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  48.61 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  48.61 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  48.33 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  49.07 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  49.28 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  48.15 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  48.61 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  47.69 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  47.69 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  47.69 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 		 226 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  47.22 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  49.76 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  47.69 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  45.45 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  46.76 
 
 		 220 aa  171  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  43.46 
 
 		 223 aa  167  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  43.54 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  40.19 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.41 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.1 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 214 aa  121  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  39.52 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  40.83 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 220 aa  98.6  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 		 216 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.13 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.16 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.13 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.67 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.67 
 
 		 203 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 198 aa  95.1  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 220 aa  94.7  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  38.15 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.16 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.65 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 378 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.28 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.67 
 
 		 203 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33 
 
 		 382 aa  92.8  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.4 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  34.95 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.44 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.83 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.95 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>