More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3448 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 210 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  51.01 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  52.04 
 
 		 228 aa  168  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  50.26 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  49.74 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  44.85 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  47.52 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  43.41 
 
 		 226 aa  143  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  44.98 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  46.57 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  44.78 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  46.11 
 
 		 210 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  41.45 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 249 aa  138  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  43.35 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  42.86 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  46 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 		 226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.1 
 
 		 378 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  33.62 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  45.23 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  32.94 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  36.07 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  38.34 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.59 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.59 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 		 445 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  39.87 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.8 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.16 
 
 		 378 aa  98.2  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 202 aa  97.8  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  43.95 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.35 
 
 		 382 aa  96.3  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.12 
 
 		 442 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.73 
 
 		 442 aa  95.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4079  Phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0325691  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.14 
 
 		 369 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 		 225 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.73 
 
 		 442 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.18 
 
 		 442 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 440 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.14 
 
 		 443 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 459 aa  92  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  42 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 233 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 449 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  40.8 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.41 
 
 		 427 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 378 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  39.61 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.58 
 
 		 444 aa  89  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.49 
 
 		 356 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.77 
 
 		 365 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.77 
 
 		 365 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  40.61 
 
 		 192 aa  89  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.77 
 
 		 365 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.91 
 
 		 442 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 411 aa  88.6  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>