More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0678 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
215 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  81.94 
 
 
216 aa  357  9e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  76.28 
 
 
215 aa  345  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  76.28 
 
 
215 aa  345  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  77.67 
 
 
215 aa  345  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  76.28 
 
 
215 aa  345  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  76.28 
 
 
215 aa  345  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  76.28 
 
 
215 aa  345  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  77.67 
 
 
215 aa  345  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  76.28 
 
 
215 aa  345  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  76.28 
 
 
215 aa  345  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  76.28 
 
 
215 aa  345  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  77.67 
 
 
215 aa  345  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  75.81 
 
 
215 aa  343  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  74.88 
 
 
215 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  74.88 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  74.88 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  74.88 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  74.88 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  74.88 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 
216 aa  332  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  73.15 
 
 
216 aa  324  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  72.22 
 
 
216 aa  317  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  40.54 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.91 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
208 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 
217 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 
224 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
214 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.63 
 
 
226 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 
223 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
220 aa  101  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
445 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
226 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
237 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
224 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  31.96 
 
 
227 aa  99  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 
240 aa  98.6  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.7 
 
 
205 aa  95.5  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 
204 aa  95.1  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 
207 aa  95.1  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
227 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.3 
 
 
229 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.3 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.3 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  38.34 
 
 
243 aa  92  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 
230 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  31.86 
 
 
229 aa  91.7  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 
195 aa  91.7  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.3 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  31.51 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  31.51 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
202 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
188 aa  89  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 
220 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.55 
 
 
207 aa  88.6  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 
196 aa  88.6  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
209 aa  88.2  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 
212 aa  88.2  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.18 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
411 aa  87.4  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 
207 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  30.85 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 
208 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
234 aa  85.5  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.16 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.34 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.93 
 
 
203 aa  85.1  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.93 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  32.34 
 
 
203 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>