More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18180 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  45.5 
 
 
204 aa  148  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  43.96 
 
 
226 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  40.98 
 
 
225 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  44.28 
 
 
228 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  45.73 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  46.11 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  44 
 
 
208 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  44.06 
 
 
232 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  41.51 
 
 
234 aa  129  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  42.08 
 
 
200 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  38.59 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.21 
 
 
210 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 
243 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 
218 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 
204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
208 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
206 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 
249 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38 
 
 
226 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  32.53 
 
 
281 aa  106  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  34.67 
 
 
203 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 
226 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 
206 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
213 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 
205 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
213 aa  102  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.81 
 
 
196 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  38 
 
 
212 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  39.74 
 
 
227 aa  101  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.21 
 
 
205 aa  101  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  39.3 
 
 
215 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 
214 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 
253 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.68 
 
 
442 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 
209 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 
223 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.63 
 
 
442 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 
230 aa  98.6  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.34 
 
 
442 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 
235 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
232 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
370 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.74 
 
 
378 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 
411 aa  95.1  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 
223 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 
445 aa  94  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  39.52 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.32 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 
233 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.95 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.89 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.89 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  36.23 
 
 
208 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 
209 aa  92  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.34 
 
 
442 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.75 
 
 
427 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  33.49 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31.52 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  29.74 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.47 
 
 
442 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 
201 aa  89.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  34.97 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.97 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 
218 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.97 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.97 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
448 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.47 
 
 
442 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 
459 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 
212 aa  88.2  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  31.58 
 
 
207 aa  88.2  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.99 
 
 
207 aa  88.2  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.75 
 
 
378 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>