More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0628 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 200 aa  417  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  89.95 
 
 		 200 aa  380  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  89.95 
 
 		 200 aa  380  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  89.45 
 
 		 200 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.99 
 
 		 442 aa  121  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  34.18 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.51 
 
 		 442 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 459 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 445 aa  118  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.84 
 
 		 207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.51 
 
 		 442 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 452 aa  115  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.02 
 
 		 442 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 449 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.7 
 
 		 442 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.51 
 
 		 444 aa  112  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.79 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.5 
 
 		 442 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 256 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 447 aa  111  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  38.99 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 448 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 448 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.68 
 
 		 442 aa  108  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 402 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 214 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.5 
 
 		 443 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.55 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 412 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 240 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  35.52 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.99 
 
 		 547 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 233 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 440 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 447 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30.57 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 411 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 253 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.69 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32 
 
 		 369 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 226 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 226 aa  98.6  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 		 591 aa  98.2  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 225 aa  97.1  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.66 
 
 		 227 aa  95.9  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.28 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.99 
 
 		 378 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 391 aa  94.4  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  29.59 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.73 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.73 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.46 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.73 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>