More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2815 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
202 aa  416  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  71.5 
 
 
200 aa  304  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  61 
 
 
200 aa  270  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  61.69 
 
 
201 aa  256  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  58.5 
 
 
217 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  52.26 
 
 
213 aa  225  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  54.5 
 
 
198 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  53.5 
 
 
198 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
591 aa  148  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
200 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  40.53 
 
 
256 aa  132  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 
241 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  38.34 
 
 
223 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  36.6 
 
 
197 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.51 
 
 
205 aa  121  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 
214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.33 
 
 
213 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
235 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 
198 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 
202 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
440 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
411 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
209 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
378 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 
201 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 
237 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29 
 
 
233 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 
196 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.85 
 
 
427 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 
209 aa  99  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
207 aa  99  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
207 aa  97.8  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
224 aa  97.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  39.08 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
402 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  30.65 
 
 
207 aa  95.1  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.69 
 
 
203 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.37 
 
 
442 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.3 
 
 
382 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.26 
 
 
201 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.16 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.37 
 
 
442 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
207 aa  92.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.65 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
227 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
218 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 
193 aa  92  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 
205 aa  92  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.84 
 
 
442 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
201 aa  91.7  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 
253 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 
217 aa  91.3  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.12 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.83 
 
 
356 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 
223 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.65 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.65 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.75 
 
 
442 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.99 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.69 
 
 
442 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
412 aa  89.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
213 aa  89  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
230 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
210 aa  87.8  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.34 
 
 
383 aa  87.8  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
214 aa  87.4  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.33 
 
 
442 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 
223 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.82 
 
 
369 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
229 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 
217 aa  87  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.11 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.56 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
240 aa  85.5  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  33 
 
 
452 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
448 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
224 aa  85.1  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.56 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>