More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4233 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
213 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  74.18 
 
 
214 aa  304  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  74.18 
 
 
214 aa  304  7e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  72.51 
 
 
212 aa  302  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  72.73 
 
 
213 aa  298  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  67.61 
 
 
215 aa  286  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  69.67 
 
 
212 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  65.4 
 
 
227 aa  274  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  65.4 
 
 
224 aa  270  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  63 
 
 
240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  58.37 
 
 
233 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  52.43 
 
 
224 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  50.48 
 
 
226 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  50.48 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  52.91 
 
 
229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 
221 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 
221 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  49.07 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  48.6 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  48.83 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  48.83 
 
 
229 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  48.58 
 
 
221 aa  188  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  49.76 
 
 
227 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  48.36 
 
 
229 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  48.36 
 
 
220 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  48.36 
 
 
220 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  48.36 
 
 
220 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  47.89 
 
 
220 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  49.06 
 
 
229 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  46.95 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  45.75 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  47.09 
 
 
224 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  44.81 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  46.48 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  42.72 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  41.75 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  40.3 
 
 
224 aa  141  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  44.93 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  43.84 
 
 
218 aa  138  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 
214 aa  137  8.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 
230 aa  131  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.98 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.27 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  38.59 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 
214 aa  111  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 
208 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
209 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  44 
 
 
198 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.85 
 
 
203 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.85 
 
 
203 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.56 
 
 
203 aa  104  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  29.06 
 
 
203 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  40 
 
 
210 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
209 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  29.06 
 
 
203 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
215 aa  101  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
215 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
215 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  41.77 
 
 
208 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
440 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  39.08 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.85 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.85 
 
 
203 aa  99  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.85 
 
 
203 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 
234 aa  98.6  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
200 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.33 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.32 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  43.67 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 
215 aa  96.3  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  45.73 
 
 
251 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34 
 
 
378 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
411 aa  95.9  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.91 
 
 
201 aa  95.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  42.95 
 
 
204 aa  94.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  32.24 
 
 
215 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>