More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0488 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.68 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.19 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.19 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.22 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.07 
 
 		 442 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 449 aa  98.6  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 411 aa  96.3  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.58 
 
 		 442 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.62 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 459 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 214 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.1 
 
 		 442 aa  95.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.62 
 
 		 443 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 226 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30660  fructose-2,6-bisphosphatase  33.5 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.243141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 447 aa  90.5  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.16 
 
 		 442 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.34 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  35.59 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 240 aa  88.6  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.54 
 
 		 442 aa  87.8  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  31.71 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.9 
 
 		 382 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.1 
 
 		 444 aa  87.8  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.1 
 
 		 442 aa  87.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.72 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 402 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  29.9 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.54 
 
 		 442 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.03 
 
 		 378 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 		 591 aa  85.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 378 aa  85.1  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 		 370 aa  84.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.43 
 
 		 547 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 447 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2994  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  26.67 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  26.67 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2126  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>