More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1544 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
256 aa  532  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  70.1 
 
 
241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  50.25 
 
 
223 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  46.35 
 
 
201 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  48.37 
 
 
197 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  43.88 
 
 
591 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  42.78 
 
 
200 aa  168  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  39.04 
 
 
213 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  45.95 
 
 
155 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 
198 aa  142  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  39.68 
 
 
200 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  38.54 
 
 
217 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.95 
 
 
201 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  39.68 
 
 
200 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  40.53 
 
 
202 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 
208 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.57 
 
 
205 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  34.76 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  34.22 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
200 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.56 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.01 
 
 
200 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
204 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 
202 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.43 
 
 
196 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
193 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.5 
 
 
200 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  33.5 
 
 
200 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 
200 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
201 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
253 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
449 aa  99  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 
205 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.86 
 
 
442 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
459 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.45 
 
 
442 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
210 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
223 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 
378 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.35 
 
 
442 aa  95.5  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.65 
 
 
444 aa  95.5  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 
209 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  30.21 
 
 
202 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.47 
 
 
443 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.45 
 
 
207 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 
207 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.86 
 
 
442 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.21 
 
 
202 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
201 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.51 
 
 
442 aa  92.8  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  30.21 
 
 
202 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 
447 aa  92.4  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  30.21 
 
 
213 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 
208 aa  92  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.65 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  31.29 
 
 
208 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 
452 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.65 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 
203 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.61 
 
 
382 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3550  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.81 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 
445 aa  89.7  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 
203 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.14 
 
 
427 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 
203 aa  89  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 
202 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.61 
 
 
198 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.4 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.4 
 
 
203 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.79 
 
 
442 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
212 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
207 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.67 
 
 
442 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.4 
 
 
203 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.4 
 
 
203 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 
237 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.4 
 
 
205 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.35 
 
 
203 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.29 
 
 
203 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 
212 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 
212 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
209 aa  85.5  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  26.29 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
200 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 
228 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.81 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>