More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4091 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  74.11 
 
 		 224 aa  317  7.999999999999999e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  69.42 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  65.4 
 
 		 213 aa  274  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  65.53 
 
 		 213 aa  274  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  66.67 
 
 		 212 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  66.34 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  67.33 
 
 		 214 aa  265  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  67.33 
 
 		 214 aa  265  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  58.41 
 
 		 240 aa  254  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  59.64 
 
 		 233 aa  248  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  52.74 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 226 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  51.22 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  47.2 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  47.2 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  48.58 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  48.34 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  46.92 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  46.73 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  48.58 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  48.34 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  48.34 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  48.78 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  47.87 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  46.88 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  44.6 
 
 		 223 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  43.35 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  44.06 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  40.69 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  38.19 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.1 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.44 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  38 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  39.91 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 214 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  38.03 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  39.52 
 
 		 225 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.47 
 
 		 382 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.14 
 
 		 378 aa  106  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  39.09 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  44.94 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  40.49 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 		 440 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  43.14 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 370 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  39.26 
 
 		 234 aa  99  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.83 
 
 		 200 aa  98.2  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.83 
 
 		 200 aa  98.2  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.5 
 
 		 378 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 213 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  44.3 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.83 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  39.35 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 201 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  35.03 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  44.94 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 411 aa  95.1  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.56 
 
 		 452 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  40.13 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 378 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  43.4 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>