More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0514 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  74.11 
 
 		 227 aa  330  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  66.51 
 
 		 215 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  65.4 
 
 		 213 aa  279  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  64.45 
 
 		 214 aa  268  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  64.45 
 
 		 214 aa  268  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  65.07 
 
 		 212 aa  268  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  62.86 
 
 		 213 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  62.68 
 
 		 212 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  63 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  65 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  54.85 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  50.95 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  50.95 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  50.71 
 
 		 227 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  51.46 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  50.24 
 
 		 221 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  50.24 
 
 		 221 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  49.06 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  49.76 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  48.58 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  49.06 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  49.06 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  49.06 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  47.17 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  49.06 
 
 		 229 aa  184  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  48.58 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  48.58 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  48.58 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  48.58 
 
 		 220 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  50.47 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  45.37 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  45.07 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  43.66 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  45.93 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  46.01 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.8 
 
 		 205 aa  131  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  38.25 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.62 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  38.59 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 		 223 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  44.94 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.25 
 
 		 382 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  46.06 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  39.52 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.47 
 
 		 378 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.82 
 
 		 378 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  33.5 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  47.17 
 
 		 251 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  33.13 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  33.13 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.51 
 
 		 442 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.21 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  41.06 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 378 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.16 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.82 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.82 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.14 
 
 		 442 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  36.67 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.92 
 
 		 203 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.92 
 
 		 203 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.59 
 
 		 442 aa  95.1  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.53 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  42.14 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.34 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.34 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 440 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  32.34 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  44.24 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>