More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0528 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  85.19 
 
 
216 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  81.94 
 
 
215 aa  357  9e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  81.02 
 
 
216 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  79.63 
 
 
216 aa  348  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 
215 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  77.31 
 
 
215 aa  337  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  77.31 
 
 
215 aa  337  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  77.31 
 
 
215 aa  337  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  77.31 
 
 
215 aa  337  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  77.31 
 
 
215 aa  337  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  77.31 
 
 
215 aa  337  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  77.31 
 
 
215 aa  337  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  77.31 
 
 
215 aa  337  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  76.85 
 
 
215 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  75 
 
 
215 aa  331  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  75 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  75 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  75 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  40.86 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.42 
 
 
213 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 
214 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 
217 aa  104  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 
210 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
220 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 
208 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
223 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 
220 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
227 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 
240 aa  99  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.44 
 
 
220 aa  99  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
237 aa  99  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 
223 aa  98.2  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 
204 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
220 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.27 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  35.37 
 
 
229 aa  95.5  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 
221 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 
221 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
226 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
203 aa  94.7  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.18 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.49 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  33.62 
 
 
229 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  33.62 
 
 
220 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  33.62 
 
 
220 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 
213 aa  91.7  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
220 aa  91.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
445 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.35 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
198 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  33.19 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  31.13 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
447 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.65 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
195 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 
218 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 
207 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
224 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
230 aa  86.3  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  29.72 
 
 
203 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.66 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.92 
 
 
442 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  29.72 
 
 
203 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.19 
 
 
203 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  33.93 
 
 
205 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.25 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
188 aa  85.5  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.66 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.68 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 
207 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.83 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31.48 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 
200 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>