More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1422 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 207 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  92.75 
 
 		 207 aa  403  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  91.79 
 
 		 207 aa  400  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.76 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.58 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  39.5 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  39.5 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 		 240 aa  107  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 217 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.3 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 440 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 221 aa  99.4  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 449 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.63 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 214 aa  97.8  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 213 aa  97.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 448 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  38.41 
 
 		 227 aa  94.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  38.15 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 223 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 448 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  38.15 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  38.79 
 
 		 180 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  28.04 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  28.04 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 447 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 237 aa  92  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 224 aa  92  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  32.66 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 218 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.44 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  32.46 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 447 aa  89.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.99 
 
 		 229 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.99 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.5 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 220 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.99 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.99 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 230 aa  89  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.94 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.5 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 241 aa  88.6  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 459 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.93 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.93 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>