More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0045 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
217 aa  443  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 
201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 
208 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  40.39 
 
 
214 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 
209 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.19 
 
 
205 aa  134  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.23 
 
 
213 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 
202 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  38.27 
 
 
196 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 
200 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
209 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  35.71 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 
211 aa  109  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
213 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 
207 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
237 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
211 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
188 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 
215 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 
215 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 
215 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
235 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 
233 aa  98.6  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
207 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
216 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  35.33 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  30.57 
 
 
203 aa  94.7  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
210 aa  95.1  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.18 
 
 
442 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  33.73 
 
 
207 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.68 
 
 
442 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.99 
 
 
442 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
233 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 
445 aa  93.2  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
447 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.02 
 
 
442 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.88 
 
 
203 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 
214 aa  92.8  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 
212 aa  92.4  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 
591 aa  92  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
223 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
225 aa  91.3  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  29.27 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.98 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
440 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.17 
 
 
443 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  31.44 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  30.93 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.66 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 
240 aa  89.4  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 
212 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 
447 aa  89  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
200 aa  89  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  31.48 
 
 
210 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
201 aa  88.6  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.05 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  30.99 
 
 
197 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.46 
 
 
201 aa  88.6  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
220 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
449 aa  88.2  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
240 aa  88.2  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.05 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  31.96 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.05 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.91 
 
 
442 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
214 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 
370 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
214 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 
204 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.69 
 
 
442 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>