More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4995 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  99.53 
 
 
215 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  91.63 
 
 
215 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  91.63 
 
 
215 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  91.63 
 
 
215 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  91.63 
 
 
215 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  91.63 
 
 
215 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  86.51 
 
 
215 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  76.28 
 
 
215 aa  345  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  77.31 
 
 
216 aa  337  5.9999999999999996e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
216 aa  328  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  75.35 
 
 
215 aa  327  9e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  75.35 
 
 
215 aa  327  9e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  75.35 
 
 
215 aa  327  9e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  74.07 
 
 
216 aa  324  6e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  73.61 
 
 
216 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 
208 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  41.08 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 
224 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 
229 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  39.52 
 
 
217 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 
210 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.78 
 
 
213 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
223 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
223 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 
214 aa  104  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
226 aa  104  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.94 
 
 
227 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 
226 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
224 aa  101  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 
204 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
203 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 
195 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
445 aa  97.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  36.04 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  33.64 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.65 
 
 
196 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 
240 aa  95.5  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 
218 aa  95.9  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  32.23 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.54 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
227 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.2 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.82 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.71 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 
205 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  34.56 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
230 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
213 aa  91.7  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
411 aa  91.7  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.71 
 
 
203 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 
188 aa  90.9  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.75 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.71 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.96 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  31.28 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 
220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.83 
 
 
449 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 
214 aa  89.4  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 
218 aa  88.6  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 
253 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  35.29 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
448 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  35.29 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.29 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
243 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  35.89 
 
 
240 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.3 
 
 
229 aa  87  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
448 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 
447 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
200 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>