More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0567 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
216 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  85.19 
 
 
216 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  80.09 
 
 
216 aa  350  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  80.09 
 
 
216 aa  347  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  76.39 
 
 
215 aa  332  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  328  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  328  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  328  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  328  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  328  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  328  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  328  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  74.54 
 
 
215 aa  328  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  75 
 
 
215 aa  328  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  74.07 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  74.07 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  74.07 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  74.07 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  74.07 
 
 
215 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  74.07 
 
 
215 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  320  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  320  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  74.54 
 
 
215 aa  320  8e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  39.78 
 
 
214 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 
208 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.42 
 
 
213 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 
210 aa  98.6  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
223 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 
226 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
240 aa  88.6  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  31.82 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.1 
 
 
203 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.19 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.19 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.61 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 
205 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.1 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.94 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.72 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31.44 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  32.12 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
411 aa  82.4  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
224 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 
228 aa  82  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.61 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
198 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.16 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.63 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  26.57 
 
 
208 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
448 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  27.01 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  32.2 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  31.42 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.59 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  30.59 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  27.96 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>