More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2039 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  46.89 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  45.85 
 
 		 218 aa  161  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  43.19 
 
 		 227 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  37.85 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  37.85 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  39.07 
 
 		 221 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  37.38 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  37.38 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  37.5 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 223 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 212 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  38.35 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  42.86 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.89 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  37.26 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.07 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4362  Phosphoglycerate mutase  32.23 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 213 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  40.7 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 190 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  38.55 
 
 		 383 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.43 
 
 		 369 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  40.51 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.52 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.52 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  38.75 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.05 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>