More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0580 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 203 aa  151  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  40.19 
 
 		 219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  33.5 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 208 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  41.35 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.65 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 207 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.72 
 
 		 442 aa  101  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 		 459 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  37.2 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.09 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.1 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.36 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 447 aa  96.3  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 445 aa  95.5  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 448 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 448 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 190 aa  94.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.57 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.57 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.39 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  34.4 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  34.4 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.93 
 
 		 443 aa  92  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 411 aa  92  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 188 aa  91.7  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  34.57 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 203 aa  91.7  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.44 
 
 		 442 aa  91.7  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.5 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  41.79 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.44 
 
 		 442 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  33.94 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  33.94 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.97 
 
 		 444 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  34.39 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  34.7 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  28.29 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  34.35 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  33.48 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  27.8 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 452 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.54 
 
 		 442 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 447 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 449 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  32.3 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>