More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2449 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 445 aa  120  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  37.13 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.89 
 
 		 442 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.89 
 
 		 442 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.89 
 
 		 442 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 459 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.43 
 
 		 442 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.02 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 449 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 452 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  36.11 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.13 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.6 
 
 		 442 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  34.54 
 
 		 448 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.51 
 
 		 442 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 448 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.42 
 
 		 442 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 207 aa  101  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 447 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 447 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.69 
 
 		 444 aa  99.4  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  40.94 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.8 
 
 		 443 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  40.16 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  36.2 
 
 		 207 aa  92.4  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  36.2 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  37.95 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.63 
 
 		 547 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.8 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 220 aa  88.6  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 220 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 215 aa  85.9  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  34.29 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 196 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 249 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 208 aa  85.1  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0752  phosphoglycerate mutase family protein  31.61 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  35.93 
 
 		 197 aa  84.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  30.77 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.8 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  31.95 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>