More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0590 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  92.35 
 
 
196 aa  376  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  64.29 
 
 
194 aa  255  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  63.27 
 
 
196 aa  250  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  52.69 
 
 
195 aa  205  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  49.73 
 
 
196 aa  194  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  48.65 
 
 
217 aa  192  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  45.99 
 
 
197 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  45.99 
 
 
197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  44.86 
 
 
198 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  47.8 
 
 
195 aa  154  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  44.86 
 
 
207 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  44.86 
 
 
198 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  43.6 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  42.93 
 
 
197 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.85 
 
 
197 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  42.17 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  41.85 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  44.17 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
214 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
195 aa  101  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 
202 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
204 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 
205 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.21 
 
 
227 aa  85.1  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 
226 aa  85.1  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.88 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  32.35 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.19 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  32.51 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
205 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 
240 aa  77.8  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
203 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  34.33 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  44 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  32.65 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10190  fructose-2,6-bisphosphatase  44.76 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.149459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  41.59 
 
 
363 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  37.25 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  34.46 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.25 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  37.25 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  34.25 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  37.25 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
191 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  39.64 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  33.52 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 
220 aa  72  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>