More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4141 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  45.55 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  45.96 
 
 		 198 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  45.79 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 195 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  47.4 
 
 		 195 aa  147  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  46.46 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  46.88 
 
 		 207 aa  143  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.89 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  38.95 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  41.97 
 
 		 197 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  43.6 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  43.32 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  44.97 
 
 		 197 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  39.47 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 222 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.04 
 
 		 222 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  45.12 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 208 aa  92  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 220 aa  91.7  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  38.95 
 
 		 214 aa  91.3  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 237 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  41.07 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.02 
 
 		 442 aa  88.6  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 227 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30.32 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.81 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.32 
 
 		 207 aa  87.8  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  35.76 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.51 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  40.44 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  33.85 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.22 
 
 		 442 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  39.16 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.39 
 
 		 442 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  38.15 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  39.31 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.16 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  32.28 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.22 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.63 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  39.24 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  38.29 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 225 aa  81.3  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  32.93 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  34.92 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  37.08 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.92 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.28 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  34.09 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35.05 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  37.72 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>