More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0513 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  63.27 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  64.29 
 
 		 196 aa  260  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  63.78 
 
 		 196 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  54.92 
 
 		 195 aa  225  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  52.85 
 
 		 196 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  52.85 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  47.92 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  46.35 
 
 		 197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  45.11 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  45.55 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  44.2 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  41.99 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  43.32 
 
 		 196 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  46.11 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  42.54 
 
 		 199 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  37.57 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36 
 
 		 227 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  39.16 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 224 aa  85.5  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.04 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  30.21 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  30.37 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  38.04 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  37.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.57 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  42.34 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 234 aa  78.2  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  41.82 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  48.15 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 449 aa  75.1  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  47.22 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 447 aa  74.7  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.72 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>