More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0856 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  34.21 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.55 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.51 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.51 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.51 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  31.07 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.51 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  39.62 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.07 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  40.18 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.09 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.05 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.77 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.05 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  29.38 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 210 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  31.34 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  26.18 
 
 		 447 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.63 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  28.37 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  26.13 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 220 aa  64.3  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.14 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.58 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.3 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.32 
 
 		 220 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>