More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1751 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
189 aa  373  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 
202 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  40.57 
 
 
208 aa  99  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
217 aa  98.2  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  40.11 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
204 aa  95.9  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  40.11 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
196 aa  95.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
195 aa  94.4  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  43.12 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 
207 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 
203 aa  91.7  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
199 aa  91.3  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 
197 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  42.33 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.26 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  34.27 
 
 
203 aa  88.2  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 
220 aa  87  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  32.02 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.02 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
196 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  31.69 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  32.02 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 
198 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 
237 aa  84.3  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
215 aa  84.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  31.46 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  32.02 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  31.46 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  32.02 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  31.46 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  35.33 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  39.26 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  35.6 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
216 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 
204 aa  79  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  40.37 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  40.94 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  41.72 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  40.4 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  33.33 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.79 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  32.2 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  35.03 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  35.03 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.03 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.59 
 
 
442 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.33 
 
 
442 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
196 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>