More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1020 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 196 aa  406  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  63.27 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  63.27 
 
 		 196 aa  250  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  61.73 
 
 		 196 aa  245  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  49.74 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  49.23 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  49.74 
 
 		 196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 197 aa  165  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  45.95 
 
 		 197 aa  157  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  43.85 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.71 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 		 207 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  40.84 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  41.71 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  40.11 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 224 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  34.43 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 222 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.8 
 
 		 222 aa  87.8  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.14 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 220 aa  85.5  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 459 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  41.96 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  39.31 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  30.85 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.12 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.12 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  45.92 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.93 
 
 		 442 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  39.62 
 
 		 447 aa  78.2  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.77 
 
 		 442 aa  78.2  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  38.41 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.86 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  40.18 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  39.81 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 448 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  39.81 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 448 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  46.3 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  40.71 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  38.39 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  34.85 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  44.76 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 240 aa  72  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  37.93 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.12 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>