More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1088 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  44.97 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  39.31 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  37.06 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  45.92 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  44.04 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.4 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  38.22 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3230  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  41.75 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  32.98 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.2 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  33.71 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  43 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3761  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.29 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  43.27 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3949  phosphoglycerate mutase family protein  31.94 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4049  phosphoglycerate mutase family protein  31.41 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00510516  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.59 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3981  phosphoglycerate mutase family protein  31.41 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3846  phosphoglycerate mutase family protein  31.94 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000331625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3677  phosphoglycerate mutase family protein  31.94 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4144  phosphoglycerate mutase family protein  31.94 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.67 
 
 		 442 aa  68.2  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  40.2 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.06 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.54 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  40.45 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  43 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 402 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.54 
 
 		 444 aa  66.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41063  predicted protein  44.34 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.95 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  25.75 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  34.09 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  25.75 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  33.89 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.93 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>