More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0356 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
205 aa  420  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 
221 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.12 
 
 
196 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 
196 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33 
 
 
214 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  29.27 
 
 
196 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
223 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 
207 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
209 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  28.36 
 
 
196 aa  99  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  27.36 
 
 
196 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  28 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  28 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  28 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.99 
 
 
205 aa  98.2  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.37 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  34.5 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 
196 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
206 aa  95.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 
370 aa  94.7  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.27 
 
 
442 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  26.37 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.73 
 
 
442 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
214 aa  92  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
224 aa  92  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 
218 aa  91.7  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.32 
 
 
442 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4423  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
222 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.120144 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.55 
 
 
442 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 
209 aa  89.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
240 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
210 aa  89  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
216 aa  89  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
224 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.83 
 
 
222 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 
215 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
195 aa  88.6  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
227 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 
208 aa  88.2  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
211 aa  87.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.86 
 
 
442 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.03 
 
 
200 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.03 
 
 
200 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
200 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
402 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
245 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.78 
 
 
442 aa  85.9  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
243 aa  85.9  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.03 
 
 
200 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
216 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
192 aa  85.1  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.85 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
208 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 
448 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 
448 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>