More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3445 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  81.61 
 
 		 223 aa  359  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  52.94 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  42.08 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.2 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.5 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  40.29 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 214 aa  118  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  39.91 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  38.21 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  38.21 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  38.1 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  37.26 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  38.57 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  38.21 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  38.21 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  37.26 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  38.21 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  36.28 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  36.06 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  37.14 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 		 221 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  46.2 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.02 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  35.41 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  37.04 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.47 
 
 		 203 aa  98.6  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.95 
 
 		 203 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  36.23 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 241 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.95 
 
 		 203 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.33 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 445 aa  95.1  7e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.72 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.99 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.16 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.16 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.99 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 209 aa  92.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.47 
 
 		 369 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  37.19 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  46.84 
 
 		 205 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 217 aa  91.7  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 		 235 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.5 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  41.48 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  36.6 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  26.79 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>