More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3400 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 223 aa  457  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  49.77 
 
 		 241 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  46.76 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  48.61 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  42.16 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  45.18 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  45.5 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  45.96 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  43 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  41.97 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  39.42 
 
 		 275 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  40.78 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  40.45 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  44.27 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  39.27 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  39.82 
 
 		 273 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  37.22 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  42.57 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  39.55 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 199 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  39.17 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  37.26 
 
 		 242 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 206 aa  128  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 		 238 aa  128  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  41 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  40.66 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  37.81 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  37.13 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.07 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 401 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.95 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 213 aa  92  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 213 aa  91.7  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.09 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.79 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.79 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.79 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  35.18 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.24 
 
 		 212 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  31.63 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 		 214 aa  85.5  6e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.51 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>