More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2169 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 208 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  59.9 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  59.8 
 
 		 207 aa  221  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  60.29 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  57.87 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  55.02 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  51 
 
 		 204 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  50.26 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  45.41 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  45.18 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  47.69 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  44 
 
 		 210 aa  131  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  40.91 
 
 		 226 aa  127  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  46.84 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  46.84 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  40.8 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  41.79 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  41.12 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  41.95 
 
 		 234 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  39.78 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  42.86 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  38.39 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  45.51 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  44.65 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  43.67 
 
 		 240 aa  104  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  44.94 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  39.25 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 		 215 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  38.69 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  40.83 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  41.77 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  40.83 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  44.62 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  35.74 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  37.73 
 
 		 223 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  39.25 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  38.37 
 
 		 445 aa  99  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 		 192 aa  98.2  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  31 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  40.38 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  42.76 
 
 		 224 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  34.42 
 
 		 232 aa  95.9  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  43.83 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 217 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  42.95 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  43.79 
 
 		 229 aa  94.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.28 
 
 		 369 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  38.25 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.92 
 
 		 442 aa  92.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  39.87 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.71 
 
 		 382 aa  92.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 213 aa  91.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.33 
 
 		 442 aa  90.1  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  38.75 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  38.01 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  38.75 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  40 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  34.5 
 
 		 201 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 448 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>