More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0008 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
241 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  88.74 
 
 
245 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  69.82 
 
 
230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  49.77 
 
 
223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  44.16 
 
 
273 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  45.85 
 
 
233 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  46.67 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  41 
 
 
204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
274 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  44.29 
 
 
242 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 
242 aa  155  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  42.66 
 
 
275 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  42.67 
 
 
234 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  40.97 
 
 
245 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  43.22 
 
 
224 aa  152  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 
236 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.99 
 
 
235 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  43.52 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 
233 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  43.88 
 
 
199 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  41.23 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  41.75 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  38.37 
 
 
234 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  41.01 
 
 
230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  42.65 
 
 
235 aa  134  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  40.72 
 
 
228 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  38.97 
 
 
221 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  39.45 
 
 
245 aa  131  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  39.17 
 
 
230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  38.31 
 
 
236 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  36.15 
 
 
261 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  40.09 
 
 
235 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  38.36 
 
 
235 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 
230 aa  121  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  40.89 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  40.89 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  40.89 
 
 
238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 
206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
209 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
201 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.17 
 
 
205 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 
235 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
208 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
204 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 
214 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
200 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  33.7 
 
 
196 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33 
 
 
202 aa  95.9  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.09 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.3 
 
 
378 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
213 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.63 
 
 
378 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
214 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 
223 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.16 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.16 
 
 
200 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.84 
 
 
382 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.16 
 
 
200 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.67 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 
378 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  32.5 
 
 
207 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 
227 aa  88.2  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
401 aa  88.6  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  33.33 
 
 
203 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
206 aa  88.6  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 
214 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  33.33 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 
440 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
213 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
228 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
200 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
211 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
207 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  35.42 
 
 
243 aa  85.1  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  33.14 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
411 aa  83.2  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  33.14 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  33.14 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  33.14 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
223 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  32.54 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>