More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4252 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  85.71 
 
 		 241 aa  427  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  72.97 
 
 		 230 aa  333  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  48.61 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  45.71 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  44.83 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  41.5 
 
 		 204 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  47.14 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  41.81 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  44.28 
 
 		 242 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  43.64 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 275 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  42.71 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  43.84 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  42.13 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  39.92 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  43.88 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 		 199 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  40.93 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  40.34 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  41.95 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  42.65 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  41.7 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  41.36 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 		 198 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  39.45 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  39.3 
 
 		 236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  41.51 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  35.55 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  38.74 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  39.52 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 206 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.33 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 201 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.61 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 204 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.27 
 
 		 378 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.02 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.12 
 
 		 378 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 223 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.15 
 
 		 382 aa  92  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.27 
 
 		 203 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.51 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  32.5 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  33.33 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  33.33 
 
 		 203 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 440 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 213 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 378 aa  89  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 225 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29 
 
 		 200 aa  88.6  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29 
 
 		 200 aa  88.6  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 228 aa  88.6  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  32.35 
 
 		 203 aa  85.1  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  32.35 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 212 aa  85.1  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  32.54 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  32.54 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.76 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  31.95 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.69 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>