More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3169 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 238 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  76.79 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  76.37 
 
 		 230 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  71.31 
 
 		 236 aa  328  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  60.17 
 
 		 234 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  59.24 
 
 		 221 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  57.32 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  58.65 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  55.47 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  57.35 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  54.77 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  55.35 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  57.56 
 
 		 245 aa  221  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  57.94 
 
 		 242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  53.81 
 
 		 233 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  57.07 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  56.5 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  49.59 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  51.94 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  49.58 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  54.63 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  50.66 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  51.21 
 
 		 224 aa  198  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  51.38 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  49.51 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  53.23 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  47.88 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  51.94 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 		 223 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  39.11 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  39.3 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  40.49 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 		 201 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  37.3 
 
 		 198 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 402 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 213 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.64 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.28 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.65 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 401 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 188 aa  72  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.5 
 
 		 378 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 211 aa  72  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.4 
 
 		 444 aa  71.6  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.27 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.27 
 
 		 200 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.27 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  26.97 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.37 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.53 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.5 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  28.72 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.09 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.21 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.02 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  26.02 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  25.4 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  39.33 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  26.02 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  24.26 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  26.29 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>