More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1955 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 230 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  82.97 
 
 		 230 aa  390  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  81.22 
 
 		 235 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  77.67 
 
 		 235 aa  316  2e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  68.72 
 
 		 234 aa  310  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  60.83 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  53.85 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  54.32 
 
 		 245 aa  224  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  58 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  55.02 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  52.3 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  53.37 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  48.28 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  54.03 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  49.79 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  48.24 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  51.69 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  47.64 
 
 		 245 aa  184  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  49.53 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  49.12 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  50.25 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  45.19 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  47.14 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  49.51 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  49.51 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  49.51 
 
 		 238 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  45.37 
 
 		 275 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  47.35 
 
 		 273 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  49.75 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  39.17 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  40.28 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 204 aa  95.5  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  39.18 
 
 		 412 aa  92.8  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 199 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 445 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 201 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 217 aa  86.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 447 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.98 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  35.29 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.5 
 
 		 442 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.38 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 214 aa  78.2  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 209 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.23 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.19 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.31 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.88 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.35 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.7 
 
 		 442 aa  75.1  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.4 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.52 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.2 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.9 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.26 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.26 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 261 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 261 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.26 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  24 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>