259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0188 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 261 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  99.23 
 
 		 261 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  52.31 
 
 		 201 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  53.46 
 
 		 204 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  52.11 
 
 		 200 aa  211  9e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  44.22 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  39.73 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  43.51 
 
 		 199 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 223 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  29.18 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  34.85 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  36.84 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  32.59 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  33.09 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.43 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  34.01 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  35.77 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  35.77 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  36.49 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  25.57 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  33.56 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.25 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  35.95 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.55 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  36.43 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.07 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  35.97 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  37.39 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.2 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  23.57 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  36.99 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  33.58 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.67 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  38.78 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.8 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.66 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  35.4 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  36.11 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  27.06 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.82 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.61 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.93 
 
 		 452 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.77 
 
 		 365 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.77 
 
 		 365 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.77 
 
 		 365 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  26.17 
 
 		 155 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>