More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3497 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  92.86 
 
 		 196 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  68.37 
 
 		 196 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  52.04 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  52.04 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  51.02 
 
 		 194 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  51.02 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  50.26 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  48 
 
 		 616 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  48 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  48 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  48 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  51.76 
 
 		 196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  48 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  48 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  48 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  47.96 
 
 		 194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  48.21 
 
 		 194 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 191 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  40.23 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  40.23 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  39.88 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.16 
 
 		 185 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 177 aa  99  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 177 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 195 aa  95.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  33.51 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.34 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.17 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.17 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.34 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.32 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.63 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  31.58 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.42 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 370 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  28.37 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  24.86 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.93 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  31.29 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  31.08 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  28.77 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  29.93 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.52 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.42 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  28.78 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.79 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.14 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  26.26 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.95 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.34 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  25.9 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  24.35 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  25.3 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.34 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.27 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  30.52 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>