229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2451 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  97.94 
 
 		 194 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  82.47 
 
 		 194 aa  296  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  88.6 
 
 		 194 aa  293  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  82.47 
 
 		 194 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  72.02 
 
 		 195 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  55.56 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  55.56 
 
 		 616 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  55.56 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  55.56 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  55.56 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  55.56 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  55.56 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  52.04 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  52.04 
 
 		 196 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  56.85 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  51.02 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  44.09 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  43.78 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  41.4 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  42.01 
 
 		 195 aa  114  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 191 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.86 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  36.96 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 177 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  44.16 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  42 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  43.71 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.52 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.52 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.92 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  39.75 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  30.97 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.69 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.62 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.56 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  37.97 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.77 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.56 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  31.71 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.06 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  29.88 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.41 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  32.47 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.44 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.61 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  29.05 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.61 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.05 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.84 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  39.19 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  25.52 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  26.15 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.49 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  30.41 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  35.62 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  32.37 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>