208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0677 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  97.04 
 
 		 203 aa  363  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  59.67 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  54.17 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  50.79 
 
 		 182 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  49.73 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  49.72 
 
 		 183 aa  157  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  47.51 
 
 		 181 aa  141  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  42.14 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 177 aa  91.3  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  38.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  38.12 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  36.52 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  38.28 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  38.31 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  35.26 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  36.41 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  41.05 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  28.76 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  32.72 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  36.96 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.1 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.79 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  36.31 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  40.91 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  36.31 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  36.31 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  36.31 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  36.31 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  36.31 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  37.63 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  39.47 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  36.31 
 
 		 616 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  37.01 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  29.17 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  37.5 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  35.44 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  36.08 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  35.67 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  41.82 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.87 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  35.4 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  26.88 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.56 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  37.5 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  29.82 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  27.37 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  33.73 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  26.75 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.86 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.35 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  36.61 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  32.08 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  25.58 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.97 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 591 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  28.67 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>