187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0845 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  52.24 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  41.33 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  38.58 
 
 		 199 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  33.5 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.93 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  34.78 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  36.36 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  34 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  35.38 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  35.66 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  29.33 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.77 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  31.39 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  26.51 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  31.39 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  31.39 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  31.39 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  31.39 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  31.39 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  31.39 
 
 		 616 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 155 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  33.83 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  27.65 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.56 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  31.65 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  32.09 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  26.32 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 391 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  32.56 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  36.7 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  41.77 
 
 		 402 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.93 
 
 		 222 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  30.4 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 389 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 440 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.31 
 
 		 378 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  28.39 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.46 
 
 		 382 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.46 
 
 		 452 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.26 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 412 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.22 
 
 		 369 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  31.58 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.03 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.79 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  36.59 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>